氣相色譜儀基線(xiàn)波動(dòng)、飄移都是基線(xiàn)問(wèn)題，基線(xiàn)問(wèn)題可使測量誤差增大，有時(shí)甚至會(huì )導致儀器無(wú)法正常使用。遇到基線(xiàn)問(wèn)題時(shí)應先檢查儀器條件是否有改變，近期是否新?lián)Q氣瓶及設備配件。如果有更換或條件有改變，則要先檢查基線(xiàn)問(wèn)題是不是由這些改變造成的，一般來(lái)說(shuō)，這種變化往往是產(chǎn)生基線(xiàn)問(wèn)題的原因。有些人在工作中就遇到過(guò)這種情形：新載氣純度不夠，換過(guò)載氣之后，基線(xiàn)逐漸上升（由于載氣凈化管的原因，基線(xiàn)不是馬上變化的）。第二天開(kāi)機之后，基線(xiàn)非常高，并伴有基線(xiàn)強烈抖動(dòng)，所有峰都淹沒(méi)在噪音中，無(wú)法檢測。經(jīng)過(guò)檢查，問(wèn)題出現在新?lián)Q的載氣上，重新更換載氣后，立即恢復了正常。
當排除了以上可能造成基線(xiàn)問(wèn)題的原因后，則應當檢查進(jìn)樣墊是否老化（應養成定期更換進(jìn)樣墊的好習慣）；石英棉是不是該更換了；襯管是否清潔。值得一提的是，清洗襯管時(shí)可先用試驗后定容的溶劑充分浸泡，再用超聲波清洗幾分鐘，然后放入高溫爐中加熱到比工作溫度略高的溫度，后再重新安裝。此外，檢測器污染也可能造成基線(xiàn)問(wèn)題，其可以通過(guò)清洗或熱清洗的方法來(lái)解決。